Reflusso nei neonati può verificarsi a causa dell'immaturità del tratto gastrointestinale superiore o quando il bambino ha qualche difficoltà nella digestione, intolleranza o allergia al latte o altri alimenti dalla sua dieta. Il reflusso in un neonato non dovrebbe essere considerato una situazione preoccupante quando la quantità è piccola e si verifica solo dopo l'alimentazione.