Controindicazioni vaccini si applicano solo i batteri o virus vaccinali attenuati, vale a dire i vaccini che sono fatti con batteri vivi o virus come vaccino BCG, MMR, varicella, polio e febbre gialla. Pertanto, questi vaccini sono controindicati per: individui immunosoppressi, come i pazienti con AIDS, in chemioterapia o trapiantati, per esempio; individui con cancro; individui che ricevono corticosteroidi ad alto dosaggio; incinta.