Trattamento della stomatite in bambino può essere fatto tenendo la bocca del bambino sempre pulito, ma per alleviare i sintomi, può essere utile usare analgesici, come il paracetamolo, per alleviare il disagio o addirittura antivirali come Zovirax, se qualcuno di essere una gengivostomatite causata dal virus dell'herpes, che aiuta a guarire le piaghe della bocca, ma solo dopo la prescrizione del pediatra.